Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms