Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRG2P13727 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRG2P13727 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms