Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms