Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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