Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC180Q9P1Z9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms