Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BARHL1Q9BZE3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms