Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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