Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms