Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms