Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms