Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC71Q8N4P6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms