Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HECW1Q76N89 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms