Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms