Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 KIAA0391-204ENST00000557404 789 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 28.31□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 28.24□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.461e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.234e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.896e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 PLXND1-202ENST00000501038 1633 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.526e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 PLXND1-204ENST00000504524 1701 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.486e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.436e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 PLXND1-214ENST00000512744 2662 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.26e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZXDC-204ENST00000515545 2635 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.126e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.046e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.034e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 213.79□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZXDC-203ENST00000514463 4639 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.226e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 NECAB3-205ENST00000473892 438 ntTSL 213.1□□□□□ -0.316e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 212□□□□□ -0.495e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 MTUS1-225ENST00000523718 3354 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.516e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC20A1-204ENST00000433924 638 ntTSL 411.61□□□□□ -0.556e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-212ENST00000478640 583 ntTSL 210.45□□□□□ -0.745e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC20A1-209ENST00000498224 692 ntTSL 210.33□□□□□ -0.766e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-202ENST00000368256 1063 ntTSL 39.83□□□□□ -0.845e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-213ENST00000489870 827 ntTSL 28.85□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC20A1-206ENST00000480984 738 ntTSL 58.08□□□□□ -1.126e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-208ENST00000415548 513 ntTSL 37.89□□□□□ -1.155e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC20A1-203ENST00000423633 668 ntTSL 27.38□□□□□ -1.236e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-215ENST00000496684 748 ntTSL 26.98□□□□□ -1.295e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-216ENST00000533194 581 ntTSL 36.67□□□□□ -1.345e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC20A1-202ENST00000413135 584 ntTSL 56.59□□□□□ -1.356e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-210ENST00000463132 610 ntTSL 36.19□□□□□ -1.425e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-207ENST00000413555 842 ntTSL 55.86□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC20A1-205ENST00000456264 574 ntTSL 45.75□□□□□ -1.496e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 CCT3-209ENST00000446905 593 ntTSL 35.02□□□□□ -1.615e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.44e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.264e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.264e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-213ENST00000626025 616 ntTSL 59.34□□□□□ -0.914e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-208ENST00000434018 523 ntTSL 39.03□□□□□ -0.964e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 ZNF133-202ENST00000360010 481 ntTSL 58.17□□□□□ -1.14e-7■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.861e-6■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.096e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.066e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.686e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 NSL1-206ENST00000626725 790 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.716e-8■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.945e-14■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.255e-14■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 EEF1D-210ENST00000525223 610 ntTSL 314.09□□□□□ -0.153e-11■□□□□ 10.7
PCBP2Q15366 TOX3-205ENST00000568436 548 ntTSL 317.59■□□□□ 0.415e-11■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 TOX3-203ENST00000563091 572 ntTSL 48.33□□□□□ -1.085e-11■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 ERCC2-210ENST00000587376 817 ntTSL 514.33□□□□□ -0.125e-6■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 SLC2A4RG-204ENST00000482718 541 ntTSL 224.8■■□□□ 1.561e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.51e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 316.66■□□□□ 0.261e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 SLC2A4RG-206ENST00000491109 637 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 CYC1-202ENST00000525122 543 ntTSL 212.24□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.063e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.393e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-9■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.173e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.112e-9■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.036e-10■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 ELMSAN1-208ENST00000476562 5314 ntTSL 219.54■□□□□ 0.725e-6■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.573e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 218.28■□□□□ 0.523e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 B4GALT7-202ENST00000502420 1305 ntTSL 517.64■□□□□ 0.413e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.33e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 CDC27-203ENST00000526866 1420 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-9■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-9■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-9■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-10■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 FKBP1B-204ENST00000438630 1137 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.083e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.046e-10■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-11■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 SDF4-204ENST00000459994 604 ntTSL 514.94□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.046e-17■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.043e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-7■□□□□ 10.6
PCBP2Q15366 TOB1-203ENST00000509385 889 ntTSL 214.63□□□□□ -0.076e-10■□□□□ 10.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 648.3 ms