Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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