Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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