Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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AP3B2Q13367 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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AP3B2Q13367 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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AP3B2Q13367 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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