Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms