Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms