Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFNP31947 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFNP31947 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms