Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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