Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC079766.1-201ENST00000608774 427 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TPT1P4-201ENST00000403538 519 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NLGN4Y-AS1-201ENST00000434164 532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC103982.1-201ENST00000561358 571 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC097478.3-201ENST00000620420 872 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms