Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLA1P09884 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLA1P09884 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLA1P09884 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLA1P09884 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms