Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN11O75508 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN11O75508 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN11O75508 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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