Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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