Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms