Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TARSL2A2RTX5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms