Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM129A0AVI4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms