Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP2BPQ9P2M1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms