Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL42Q9P2K6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms