Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms