Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms