Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms