Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VWC2Q2TAL6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms