Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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