Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms