Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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