Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA2Q15596 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms