Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms