Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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