Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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