Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DMPKQ09013 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DMPKQ09013 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms