Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms