Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms