Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285 ms