Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms