Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms