Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCNN1GP51170 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms