Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms