Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 425.7 ms